-再会編-

　南斗聖拳最強の男、聖帝サウザー。覇道を成すために避けられぬその相手を偵察に訪れたラオウは、完成を間近に控えた「聖帝十字陵」の威容を目にする。それは、聖帝の権威を誇示せんがための巨大な墓標・・・。そしてその建設作業を強いられていたのは、聖帝軍によって連れ浚われた子供達であった。反抗する大人よりも、従順な子供達を使う・・・それが聖帝なる男のやり方であった。

　聖帝軍に子供を献上しようとする盗賊から、とある一家を守ったケンシロウ。だがその時、聖帝軍と対立する別の組織が現れる。彼らを率いるは、南斗白鷺拳のシュウ。盲目の闘将と呼ばれるその男の目は、深く刻まれた傷痕と共に、両目の光を失っていた。有無を言わさず闘いを挑んできたシュウは、華麗なる脚技でケンシロウを攻め立てる。だがケンシロウの強さはその一つ先を行っていた。北斗神拳奥義 水影心。一度闘った相手の拳を修得できるというその奥義で、遠方から切り刻む南斗聖拳を繰り出すケン。だがケンは、シュウに止めを刺さなかった。シュウの拳に殺気が無い事を、ケンは見抜いていたのだった。
　その闘いを止めたのは、リンとバットであった。ケンを探しに荒野へ出た二人は、シュウによって危機を救われていたのである。シュウの目的は、命を賭けてケンシロウの力を量ることであった。聖帝サウザーを倒しうる唯一の男であるケンを、シュウは待ち続けていたのだった。

　流民の集団が襲われているとの報せを受けたシュウは、ケンと共に救出へと向かう。子供の命を蔑ろにする聖帝軍に向け、シュウは言った。「子供達の光を奪い去ることは許さん！」。その言葉を、ケンは遠い昔に耳にしていた。幼き頃、ケンが挑んだ「南斗十人組手」なる試練。それは、南斗の拳士10人を相手に戦い、全員に勝ち抜かねば生還できないという過酷なものであった。そこでケンシロウの才を目にしたシュウは、十人目の相手として名乗りを上げ、ケンを圧倒する。しかしシュウはケンを殺させようとはせず、その代償として自らの両目を潰した。シュウの宿星である仁星は、ケンシロウという光に、誰よりも強く輝く可能性を感じていたのだった。そして今、ケンシロウとの再会を果たしたシュウは、かつて己が感じた予感が正しかったことを確信していたのだった。

-敗北編-

　ケン達が案内されたシュウのアジトは、戦前の下水道の中に作られた質素なものであった。南斗六聖拳最強の男であるサウザーは、他の南斗の拳士では勝つことは出来ない。故にシュウはゲリラとなって抵抗することしかできずにいたのだった。

　その時、レジスタンスの部隊が、聖帝の小隊から食料を奪って帰還した。だがその食べ物には全て毒が入れられており、一人の少年が命を落としてしまう。あまりにも非道なるその聖帝のやり方に、ケンシロウは激しい怒りを覚えるのだった。

　行進する聖帝サウザーの軍勢の前に、ケンシロウが立ちはだかる。嗾けられた南斗双斬拳の二人を難なく撃破し、その成長を見せ付けるケンシロウであったが、サウザーはその不遜な態度を一向に崩すことは無かった。帝王であるサウザーの拳に防御は無い。あるのは制圧前進のみ。無為の構えから一瞬にして間合いを詰める突進で、ケンシロウを攻め立てるサウザー。だが一度戦った相手の拳を見切ることのできるケンシロウに、同じ攻撃は二度通用しなかった。必殺の極星十字拳を躱し、サウザーの身体の秘孔を連続で刺突するケンシロウ。貴様の命はあと3秒。そう宣告するケンであったが、3秒後に血を吹いたのはケンシロウの方であった。経絡秘孔の効かない「帝王の体」。その謎こそが、ラオウがサウザーとの戦いを避けていた理由なのであった。

　深手を負い、牢獄に囚われたケンシロウの前に、一人の少年が現れる。彼の名はシバ。シュウの一人息子であった。サウザーを倒せるのはケンシロウを置いて他に無い。その父の言葉を信じ、動けぬケンシロウを抱えて逃亡を図るシバ。だがこのままで逃げきぬと踏んだシバは、追っ手達を巻き込んで自爆するという道を選んだ。幼きシバにもまた父シュウと同じ、仁星の血が流れていたのであった。

　ケンシロウが目覚めた時、そこはシュウのアジトの中であった。ケンを救ったのはラオウであった。サウザーの体の謎を解明するため・・・ラオウはまだケンシロウを死なせるわけにはいかなかったのだった。

-復活編-

　聖帝十字陵の完成を間近に控え、聖帝による本格的なレジスタンス狩りが開始された。大軍勢がアジトに向かっている事を知ったシュウは、眠るケンシロウを地下水路から送り出し、命を賭してサウザーへと立ち向かう。だが、百人の人質をとられたシュウには、戦うことすら許されなかった。両足の腱を切られて敗北したシュウは、無念の涙を流し、魂の叫びをこだまさせる。その強敵の呼ぶ声は、ケンシロウを深き眠りから呼び覚ました。

　百人の人質と引き換えにサウザーがシュウに命じたのは、聖帝十字陵の頂まで聖碑を運ばせるというものであった。それは、反逆者のリーダーであるシュウの手で、聖帝の権威の象徴を完成させるという、あまりにも皮肉な刑であった。腱を切断された両足で、巨大な石碑を抱えながら階段を登り続けるシュウ。そしてその足が最後の一段に差し掛かったとき、遂にケンシロウが駆けつけた。そして同時に、ラオウ、トキの二人もその場に現れた。トキは、サウザーの体の謎の正体を知っていたのだった。

　頂上へと辿りついたシュウの身体に、無数の矢が打ち込まれる。急いで頂上へと駆け上るケンシロウであったが、それを嘲笑うかのように、サウザーの放った槍がシュウの身体を貫いた。だがその時、奇跡が起こった。光を失ったはずのシュウの目に、ケンシロウの顔が映ったのである。成長したケンの姿を見て、仁星の血が間違っていなかったことを確信したシュウは、ケンシロウの拳に時代を託し、聖碑の下で眠りについたのであった。

　ケンシロウとの最後の決着をつけるため、十字陵の階段を登っていくサウザー。その時、シュウの仇をとらんとする少年が、サウザーの足に釘を突き立てる。その少年の行為を指し、サウザーは言った。愛が人を狂わせる・・・愛ゆえに人は哀しみ、苦しまねばならぬのだと。かつて孤児だったサウザーは、先代南斗鳳凰拳伝承者オウガイに拾われ、拳を学んだ。だが15歳になった時、サウザーは鳳凰拳の伝承者となる試練において、相手が師オウガイと知らずに命を奪ってしまった。そのあまりに大きな哀しみから逃れるため、サウザーは愛を捨てて生きることを選んだのであった。聖帝十字陵は、サウザーの愛と情の墓であり、師オウガイへの最後の心なのであった。

　ケンシロウがいくら攻撃を当てても、やはりサウザーの秘孔を突くことはできなかった。だがサウザーの身体に両手の指を突き入れたその時、ケンはその血の流れに違和感を覚える。サウザーの拳に切り裂かれ、再び流血に塗れるケンシロウであったが、その時、サウザーの額から血が流れ落ちた。それは、遂にケンシロウが帝王の体の正体を掴んだ証であった。心臓の位置も逆、そして秘孔の位置も表裏逆。その特異体質が、ケンシロウの秘孔術を無効化させていたのであった。

　体の謎を見切られたサウザーであったが、鳳凰拳にはまだ秘拳が残されていた。天翔十字鳳。それは、対等の敵が現れたときに帝王自ら虚を捨てて立ち向かう、誇りをかけた不敗の拳であった。対するケンシロウも、秘奥義 天破の構えで応える。天空に舞う羽と化したその身体で、ケンシロウの攻撃を空切らせるサウザー。しかし、止めを刺さんとサウザーが跳躍したその時、ケンシロウが構えから攻撃に転じる。北斗神拳奥義 天破活殺。ケンシロウの指先から放たれた闘気が、宙空を舞うサウザーの秘孔を捉えた。体表に秘孔を浮き上がり、更に宙を舞う足の力までも奪われたサウザーに、もはや勝機はなかった。退かぬ！媚びぬ！省みぬ！帝王としての誇りをもって繰り出されたサウザーの攻撃を、渾身の一撃で迎撃するケンシロウ。だがそれは、苦痛を生まぬ北斗有情猛翔破であった。幼き日の温もりを知るが故に・・・誰よりも深い愛を持つが故にサウザーが狂ってしまったのだと言う事を、ケンシロウは知っていたのであった。

　師オウガイの亡骸に寄り添いながら、息絶えるサウザー。その哀しき男の死に呼応するかのように、聖帝十字陵の頂からシュウの血が流れ落ちる。同時に、十字陵は音を立てて崩壊を始めた。それは、聖帝軍という巨大勢力の終焉を意味していた。